第4章 2027年度教員と五つの研究例
東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻の院試対策講座から、出願用教員一覧を基準に、公式プロフィール、研究者データベース、原著へ進みます。
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- 院試クラウド編集部
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2027年度修士一覧の20名を出願の基準にする
修士課程の出願候補を、研究室の印象で補いません。
大学公式の事実:修士一覧には20名が載る
2026年6月9日更新の修士出願用一覧と組織規則を使っています。
2027年度修士一覧には、生物情報工学、分子育種学、醗酵学、酵素学、微生物学、細胞遺伝学、応用微生物学、環境保全工学、細胞機能工学、植物機能工学、生命情報解析と、三つの社会連携分野に計20名が載ります。組織規則も基幹講座と社会連携講座を置いています。
本書による説明:出願用一覧を入口にする
修士課程の出願資格と研究内容を同時に確かめるための資料順です。
研究テーマが魅力的でも、2027年度修士課程用一覧に教員名がなければ、その人を修士の志望指導教員として確定できません。最初に修士一覧、次に公式プロフィールと研究者データベース、最後に原著論文という順で深めます。
五人を専門分野と方法で比べる
教員名だけでなく、材料、方法、問いを具体化します。
大学公式の事実:寺田透教授・生物情報工学
修士一覧、個人公式プロフィール、研究者データベースの三系統を照合しています。
寺田透教授は2027年度修士一覧で生物情報工学に載ります。公式プロフィールは、タンパク質を原子レベルで理解する分子シミュレーション、構造バイオインフォマティクス、機能予測を説明し、researchmapは所属、論文、担当授業を掲載しています。
大学公式の事実:葛山智久教授・分子育種学
2027年度の出願用一覧と、現在公開されている研究内容を分けて確認しています。
葛山智久教授は2027年度修士一覧で分子育種学に載ります。公式プロフィールは微生物が作る天然物の生合成機構と合成生物学を研究対象とし、researchmapでは所属、研究分野、論文を確認できます。
大学公式の事実:伏信進矢教授・酵素学
修士一覧、公式プロフィール、研究者データベースを照合しています。
伏信進矢教授は2027年度修士一覧で酵素学に載ります。公式プロフィールは糖質分解酵素の立体構造と機能、腸内細菌・バイオマス・物質生産への展開を説明し、researchmapには論文と生体触媒分子論などの担当経験が掲載されています。
大学公式の事実:丸山潤一教授・微生物学
出願用一覧と二つの研究プロフィールを確認しています。
丸山潤一教授は2027年度修士一覧で微生物学に載ります。公式プロフィールは麹菌と糸状菌を対象に、細胞生物学、遺伝子、発酵・酵素生産を研究する内容を示し、researchmapには所属、研究分野、論文が掲載されています。
大学公式の事実:加藤創一郎教授・応用微生物学
2027年度一覧、公式プロフィール、研究者データベースで役割と研究範囲を確認しています。
加藤創一郎教授は2027年度修士一覧で応用微生物学に載ります。公式プロフィールは微生物機能・代謝、二酸化炭素利用、電子移動、メタノールを介する共生などを説明し、researchmapでは東京大学の所属と論文を確認できます。
原著論文で方法・結果・限界を読む
研究発表だけでなく、取得できた本文または抄録の範囲を守ります。
大学公式の事実:配列と構造を使う酵素機能予測FUJISAN
PMC原著全文と大学公式発表の一致する方法・結果に限定しています。
寺田教授らは、二つのタンパク質が同じ酵素反応を触媒するかを、配列と構造の類似性から予測するFUJISANを開発しました。原著はAlphaFold2構造、ドメイン、反応ポケット等の特徴を使い、研究内の比較条件で配列だけの方法や比較対象モデルより高い性能を報告しています。
大学公式の事実:シスペンタシンを作るII型PKS様機構
PMC原著全文と大学公式発表で確認した生合成機構の範囲です。
葛山教授らは、通常は芳香族骨格を作るII型ポリケチド合成酵素に似た酵素群が、シスペンタシンの環状骨格を作る機構を示しました。原著では遺伝子クラスター、酵素機能、反応段階を調べ、複数酵素を組み合わせた合成も報告しています。
大学公式の事実:β-グルコシダーゼの三状態とY295
PMC原著全文と大学公式発表の構造解析・変異体実験を確認しています。
伏信教授らはTd2F2というβ-グルコシダーゼについて、基質非結合、共有結合中間体、生成物結合の三状態をX線と中性子で解析しました。Y295、E352、水分子の位置変化を調べ、Y295F変異体の反応速度測定からY295が反応の二段階に関わることを支持しました。
大学公式の事実:麹菌の細胞体積・核数と酵素生産
eLife Version of Record全文と大学公式発表で、観察、相関、提案モデルを区別しています。
丸山教授らは麹菌の培養で太い菌糸が増え、初期菌糸より細胞体積と核数が約10倍、核数が200以上となる状態を観察しました。細胞体積・核数の増加とアミラーゼ活性・分泌タンパク質量との相関、関係する因子を調べ、制御モデルを提案しています。
大学公式の事実:メタノールを渡す細菌とメタン生成アーキア
出版社本文は取得していないため、PubMed原著抄録と国研公式発表を超える詳細は加えていません。
加藤教授らの研究は、地下由来細菌がギ酸からメタノールを生じ、メチル利用アーキアへ渡してメタン生成につながる共生を報告しました。PubMed原著抄録と産総研発表では、単独・共培養、代謝物検出、安定同位体追跡などで経路を検討したことを確認できます。
研究室選択で断定してよい範囲
研究内容と、受入れ・設備・指導制度の未公表情報を分けます。
大学が公表していない情報:教員別残余枠・設備利用・全担当科目
教員一覧、便覧、カリキュラムにない個別運用を研究実績から推測しないための境界です。
確認資料からは、各教員の2027年度の残余受入枠、学生数上限、入学後に必ず使える装置や試料、個別の面談頻度を確定できません。また取得した2026年度Catalogだけでは、葛山教授・丸山教授を含む全教員の担当科目を網羅したとはいえません。
本書の提案:材料・方法・問いの三列で比べる
研究テーマを出願判断へ具体化する独自比較法です。
「タンパク質配列・機械学習・機能予測」「天然物遺伝子・酵素解析・骨格形成」「麹菌・顕微鏡と遺伝学・酵素生産」のように三列で整理します。分野名だけでなく、自分が毎日扱いたい材料と方法まで比べます。
本書の提案:論文は対象・方法・結果・限界の四行で読む
大学指定の面談課題ではなく、原著を過不足なく説明するための読解法です。
対象は何か、何を測ったか、どの比較で何が分かったか、どこまで一般化できないかを一行ずつ書きます。面談では「面白かった」だけでなく、追加したい対照実験や別の材料を一つ質問にします。
この章で確認した一次資料
公開本文の作成にあたり、以下の資料を確認しました。入試条件は変更されるため、出願時は必ず大学の最新情報と照合してください。
- 令和9(2027)年度 教員並びに専門分野一覧(修士課程用)
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:2026-06-09更新|確認:2026-08-30|参照箇所:PDF物理p.1、応用生命工学欄の20名・専門分野と、願書はこの一覧から選ぶ旨
- 東京大学大学院農学生命科学研究科組織規則
東京大学|資料:2026-04-01施行版|確認:2026-08-30|参照箇所:PDF物理pp.1-2、応用生命工学専攻の基幹講座と社会連携講座
- 令和8(2026)年度 大学院便覧
東京大学|資料:2026年度・2026-04-01公開|確認:2026-08-30|参照箇所:PDF物理p.8の修士30単位・算入上限・科目、pp.30-32の2026年度時間割
- 応用生命化学専攻/応用生命工学専攻 カリキュラム
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:修士課程、2026年度開講、2027年度開講(予定)の各見出しと科目一覧
- 寺田透教授 公式プロフィール
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:氏名・職名・専攻・研究室、研究内容、教育内容。分子動力学、タンパク質機能、構造情報
- 葛山智久教授 公式プロフィール
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:氏名・職名・専攻・研究室、研究内容、教育内容。天然物生合成と合成生物学
- 伏信進矢教授 公式プロフィール
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:氏名・職名・専攻・研究室、研究内容、教育内容。糖質分解酵素の構造と機能
- 丸山潤一教授 公式プロフィール
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:氏名・職名・専攻・研究室、研究内容、教育内容。麹菌、糸状菌、発酵
- 加藤創一郎教授 公式プロフィール
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:更新日表示なし・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:氏名・職名・専攻・研究室、研究内容、教育内容。微生物機能・代謝と微生物間相互作用
- 寺田透 researchmap
researchmap(科学技術振興機構)|資料:項目ごとの更新表示・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:基本情報、所属、研究分野、論文、担当経験のある科目
- 葛山智久 researchmap
researchmap(科学技術振興機構)|資料:項目ごとの更新表示・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:基本情報、所属、研究分野、論文
- 伏信進矢 researchmap
researchmap(科学技術振興機構)|資料:項目ごとの更新表示・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:基本情報、所属、研究分野、論文、担当経験のある科目
- 丸山潤一 researchmap
researchmap(科学技術振興機構)|資料:項目ごとの更新表示・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:基本情報、所属、研究分野、論文
- 加藤創一郎 researchmap
researchmap(科学技術振興機構)|資料:項目ごとの更新表示・2026-08-30確認|確認:2026-08-30|参照箇所:基本情報、所属、研究分野、論文
- Enhanced prediction of protein functional identity through the integration of sequence and structural features
Computational and Structural Biotechnology Journal / PubMed Central|資料:2024-11-14|確認:2026-08-30|参照箇所:PMC全文のAbstract、Methods、Results、Discussion、Data availability。DOI 10.1016/j.csbj.2024.11.028
- Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for the biosynthesis of cispentacin
Nature Communications / PubMed Central|資料:2023-12-06|確認:2026-08-30|参照箇所:PMC全文のAbstract、Results、Methods、Data availability。DOI 10.1038/s41467-023-43731-z
- Neutron crystallography of the covalent intermediate of β-glucosidase reveals remodeling of the catalytic center
Proceedings of the National Academy of Sciences / PubMed Central|資料:2025-10-30電子公開|確認:2026-08-30|参照箇所:PMC全文のAbstract、Results、Methods、Discussion。DOI 10.1073/pnas.2502828122
- The increase in cell volume and nuclear number of the koji-fungus Aspergillus oryzae contributes to its high enzyme productivity
eLife|資料:Version of Record 2025-09-23|確認:2026-08-30|参照箇所:Version of Record全文のAbstract、Results、Methods、Discussion、版履歴。DOI 10.7554/eLife.107043.4
- Methanol transfer supports metabolic syntrophy between bacteria and archaea
Nature / PubMed|資料:2025-01-29電子公開・Nature 2025-03|確認:2026-08-30|参照箇所:PubMed PMID 39880954の書誌と原著抄録。DOI 10.1038/s41586-024-08491-w。出版社本文は未取得
- 機械学習を用いたタンパク質ペアの酵素触媒反応の同一性予測手法の開発
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:2024-12-02|確認:2026-08-30|参照箇所:発表のポイント、発表内容、比較結果、論文情報
- 天然化合物の環状骨格をつくり上げる新たな生合成マシナリーの発見
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:2024-07-09|確認:2026-08-30|参照箇所:発表のポイント、発表内容、論文情報、II型PKS等の用語解説
- β-グルコシダーゼの中性子構造解析により未知の反応機構を解明
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:2025-10-18|確認:2026-08-30|参照箇所:発表のポイント、3状態の構造、Y295変異体、論文情報、用語解説
- 麹菌の酵素生産能の高さは菌糸細胞体積と核数の増加による
東京大学大学院農学生命科学研究科|資料:2025-09-23|確認:2026-08-30|参照箇所:細胞体積・核数・酵素生産の概要、研究内容、今後の展開、論文情報
- 地下微生物はメタノールで飲みニケーション!?
産業技術総合研究所|資料:2025-01-30|確認:2026-08-30|参照箇所:発表のポイント、共培養・代謝物・同位体追跡、論文情報