この講座の対象は、東京大学大学院薬学系研究科薬科学専攻の修士課程です。組織規則は薬科学専攻に修士と博士後期を置き、基幹講座を有機薬科学、物理薬科学、生物薬科学としています。修士課程は、有機化学、物理化学、生物化学を機軸に、化学系・物理系・生物系薬学を広く扱う創薬科学研究者と基礎生命科学研究者の養成を掲げます。修了時の学位は修士（薬科学）です。

選抜は、筆記、オンライン口述、TOEFL iBT、出身校の成績で総合判定します。日本の大学を卒業していない外国人は、一定の例外を除き外国人留学生特別選抜です。在職のまま入学を希望する人は社会人特別選抜です。募集100名には社会人特別選抜と外国人留学生特別選抜の各若干名を含みます。これらは別専攻ではなく、同じ薬科学専攻修士の選抜区分です。